La etapa de floración se produce durante el segundo ciclo de crecimiento, una vez que se elonga el tallo floral. Las flores son pequeñas, sésiles y de color verdoso; en los cultivares de remolacha monogérmica, las flores se encuentran en forma solitaria; en tanto, que en los cultivares de remolacha multigérmica, pueden presentarse solitarias o en grupos de dos a cinco; en este último caso, las flores se presentan soldadas en sus bases conformando un glomérulo (Figura 15).
 
 

A pesar que las flores son perfectas, la polinización de la remolacha generalmente es cruzada; esto, debido a que las plantas presentan dicogamia, lo que determina que los órganos masculinos y femeninos maduren desfasadamente. La polinización es principalmente anemófila y se prolonga durante toda la etapa de floración.

Las flores, ya sea solas o en grupos (glomérulos), se encuentran formando parte de espigas; estas últimas pueden ubicarse en posición lateral o terminal dentro da cada inflorescencia (Figura 16). Cabe destacar que en el caso de la remolacha, se habla de una inflorescencia mixta, ya que tanto los glomérulos por un lado, como las espigas por otro, constituyen inflorescencias.