El neurotransmisor principal es el ácido gama-ámino-butírico (GABA). Se le considera el principal neurotransmisor inhibidor en el sistema nervioso central. Desde el punto de vista funcional se le relaciona con:
depresiones de la actividad cerebral y motora
regulador en circuitos locales en diferentes regiones del sistema nervioso
trastornos neurológicos y psiquiátricos: enfermedad de Huntington, de Parkinson, epilepsia, esquizofrenia, disquinesia tardía, demencia senil.
Sistemas de neuronas de axón corto. Representado por neuronas inhibidoras que se ubican en diversas regiones del sistema nervioso central, como la corteza cerebral, el cuerpo estriado, el hipocampo, la médula espinal.
Sistemas de proyección. Por ejemplo, el de las células de Purkinje del cerebelo que proyectan a los núcleos Vestibular y Cerebeloso. El de las neuronas estriatales que proyectan a la substancia nigra.
